Il target è il medesimo. La differenza è che MOS è molto più curato e ottimizzato.
Però visto come vanno le cose ultimamente nel team AROS, non mi sorprenderei se nei prossimi 1-2 anni avvenisse un sorpasso come qualità dell'OS, anche se in realtà MOS ha un'architettura superiore alla base (intendo a livello di struttura dell'OS), mentre AROS tende a imitare l'architettura di AmigaOS 3.1 che è molto più all'antica.
Io mi diverto con entrambi, anche se uso più spesso AROS per la comodità di averlo in VirtualBox sul portatile, mentre per MOS devo trovarmi a casa e sgomberare la scrivania di proposito
